Все нужно для полной ясности. По этому тексту нельзя понять
1. Какой ftp-сервер.
2. Как настроили FTP-сервер.
3. Куда разрешили права на запись.
4. Каким браузером создаете папки (например, если браузер это Firefox, то так не бывает!).
5. Как копируйте файлы на сервер
и т.д.
Подсказка. Зайдите на сервер по ssh и посмотрите при помощи ls -l что происходит в тех каталогах, куда должны по FTP заливаться файлы.