Всё понятно. Проблеме уже пошёл второй месяц, однако, поиски способа её решения нигде не нашёл. Эксперимент с Альтом оказался неудачным. Надо возвращаться на Debian. За более чем 15 лет общения с ним были разные проблемы, но таких нерешаемых, как в Альте не было.
Пытался почистить систему по аналогии, как я это делал в Fedora и Debian - полный облом.
К тому же я уже нашёл способ зашиты от санкций, на домашнем сервере отключил обновления и обнулил репозитории, просто в файле /etc/apt/sources.list закомментировал все строки, а на десктопе регулярно, перед обновлением создаю инкрементные образы системы в Acronis, как только возникнет проблема, всегда могу сделать откат системы до стабильного состояния.
PS: Аналогичная проблема была в Arch Linux и Manjaro, только в них очень быстро заканчивался свободный объём в домашнем каталоге, он исчезал даже при полном отсутствии в нём личных файлов. Причину нашёл, но не устранил. Система, зачем-то, делает полную копию содержимого корневого каталога в домашний и ставит на всё это атрибут "скрытый".
