Кажется постиг дзен базового уровня. Как и следовало ожидать изрядно накосили со сборкой. Во вложении сборка с granite. NoJS появилось (как и ещё пачка ранее отсутсвовавших дополнений), работает. AdBlock теперь обновляется и работает. Ушёл косяк с фоновым изображением. Починилось окно настроек шрифта (ранее, как оказалось вообще не отображались виджеты "entry"). Кстати, Midori гораздо лучше работает с FullHD-монитором — нет микроскопических шрифтов на Web-страницах. Единственное, что осталось — залезание развёрнутого окна под панель (с этим ещё поразбираемся).
Надо ещё поиграть с другими вариантами сборки. Мне кажется лучше собирать без granite и gtk3, поскольку и то и другое тащит в систему дополнительные зависимости. А это для браузера позиционирующего себя как лёгкий не есть хорошо.