но МФУ так не умеют у них должен быть прописан каталог.
Так и пропишите в МФУ путь к каталогу scan, а на /mnt/smb/scan сделайте в домашнем каталоге символическую ссылку.
ln -s /mnt/smb/scan ~/scan
Какое МФУ?
Настраивайте FTP на сервере.
Создайте на сервере отдельного пользователя netscan и задайте ему домашний каталог scan в каталоге с ресурсами samba.
Создайте в smb.conf ресурс [scan].
Тогда все ваши условия будут соблюдены, в МФУ не надо прописывать каталог, пользователи будут забирать файлы по протоколу smb из ресурса scan, и от вашего компьютера вся конструкция не будет зависеть.