Сервер сделать в маленькой коробочке, коорую можно запитать по PoE и таки вытащить на улицу.
Лучше в коробочке вытащить не весь сервер, а только приёмник и антенну, можно хоть всё это целиком залить герметиком вместе с кабельным вводом.
Питание, PPS и UART в виде RS-485(422) - по ethernet кабелю, можно экранированному.
Chronyd не очень по вкусу изменения температуры внутри сервера, точность падает. Сервер лучше в помещении оставить.