В общем, похоже, самостоятельная сборка попадает под пункт 12. Если я правильно перевёл, то он требует одобрения Moonchild на использование названия Pale Moon и официального дизайна, либо существенного изменения дизайна и названия.
При этом, пункт 13 описывает неофициальный дизайн "New Moon", который можно использовать без ограничений и который, вроде как, в тех же исходниках присутствует. Его там, вероятно, можно как-то указать при сборке.
Если всё так, то, вероятно, в newmoon надо и пакет переименовать. С добавлением "Obsoletes: palemoon" точно, и с "Provides: palemoon", думаю, тоже, чтобы искалось/ставилось по этому имени. Если имя бинарника меняется, то, может быть, с симлинком.