Из Альта vesa удалить не удаётся безболезненно
Ради эксперимента, кстати, можно было попробовать удалить без учёта зависимостей:
rpm -e --nodeps xorg-drv-vesa
Это разломает базу rpm, без восстановления (apt-get --fix-broken install должно хватить) потом ничего не поставишь, но для проверки, наверное, можно было бы использовать.