bus.gov.ru нужен максимум 1-2 раза за год, я не помню остались ли с ним проблемы. И в 2018 году ЕИС тоже только в IE работала, с тех пор все поменялось в лучшую сторону.
А требование windows зачастую прописано в руководящих документах ИС имеющих только веб-интерфейс и не использующих никакой криптографии или плагинов. И юзер приходит и тычет в инструкцию что "ему надо туда, а ведь ничего работать не будет" (без проверки естественно и всё по факту работает без вопросов).
Для бухгалтерии остаются вопросы по системам ДБО, таким как например
https://bo.vtb24.ru/ (плагин только для винды и OS X), это нужно регулярно не менее 2х раз в месяц для перечисления з/п