Решил похожую проблему, целый день на неё потратил.
Проблема:
В колонках не слышен звук, который поступает на линейный вход, при этом Audacity его успешно записывает и потом воспроизводит запись (звук с тв-тюнера, видео магнитофона...). Регулировка в стандартных настройках звука MATE и программе "Регулятор громкости PulseAudio" ничего не меняет, звук визуально виден на уровне записи, но не слышен.
Решение:
Установите микшер qamix (QAMix is a configurable mixer for ALSA), это аналог микшера Windows. Далее на вкладке "Ext. Source Playback", у регулятора "Line" отключаете опцию "Mute" и поднимаете уровень на 100.
Добавил:
Лучше использовать Alsamixer-Qt4, там все возможные регуляторы вашей системы, больше опций и выглядит он получше.
• Альт Сервер 8.2 i586 (MATE)
• Multimedia audio controller: VIA Technologies, Inc. VT8233/A/8235/8237 AC97 Audio Controller (rev 60)
• Subsystem: Micro-Star International Co., Ltd. [MSI] Device 0430
• Kernel driver in use: snd_via82xx