У audacity по-умолчанию каталог для временныйх файлов /tmp/....
Надо посмотреть в каком разделе лежит /tmp (варианты - корень, /home, озу(tmpfs)) и его или увеличить, или переназначить. Быстрее всего работает, когда /tmp в tmpfs, но в этом случае хорошо иметь большой swap, для больших файлов.