Проблема только в Х (иксах - Simply Linux, XFCE). Из под "консоли" (в текстовом режиме) всё работает нормально. Возможно, что-то нехватает PAM-у в графической сессии. Система после неудачного апдейта, 70% процентов пакетов было удалено, пакеты доустанавливал вручную.