В любых приложениях запускаемых wine имеющих стандартный вид windows gui включая и wine конфигуратор пропадает курсор мыши, при этом если курсор имеет нестандартный вид например в играх то его видно...
появилось это после установки драйверов via-openchrome
Система Alt 4.1
Стоят пакеты libwine, libwine-gl,wine версия 1.0.9
Судя по сайту разработчиков openchrome версия драйверов самая последняя.
В общем решение подсказали на linuxforum.ru
В xorg.conf в секции для видеокарты добавляем 2 строчки.
Section Device
Identifier string #идентификатор вашей видеокарты
Driver openchrome
...
Option "SWCursor" "true"
Option "HWCursor" "false"
...
EndSection