yd-tool - "Утилита поддерживает почти все основные функции консольного клиента, кроме выборочной синхронизации. Добавляет в контекстное меню пункты, отвечающие за публикацию." Взято с GUI для Диска 
Ага я читал, что там написано и ни один из данных клиентов не поддерживает всех команд.
ya-gui - Утилита позволяет запустить демон в обычном или расширенном режиме (с дополнительными опциями). Добавляет в контекстное меню пункт, отвечающий за публикацию. В запущенном состоянии позволяет открыть или закрыть доступ к файлам, остановить демон, а также отображает информацию о текущем статусе демона.
У нее 2 команды, а в расширенном режиме 5ть. Это реклама.
Yandex.Disk ServiceMenu - Позволяет получить быстрый доступ к сервису Яндекс.Диск: скопировать публичную ссылку на файл или папку в буфер обмена, сохранить файл в вашу папку Яндекс.Диска.
Это расширение для Dolphin, оно устанавливается через настройки действий Dolphin.
Виджет Magic Folder - Позволяет получить ссылку на публикацию.
Это скрипт и там описывается как его сделать, сделать можно на какой угодно ос.
Говорится там и о vebdav, причем в списке программ, поддерживающих vebdav, среди файловых менеджеров нет Thunar, которымя я пользуюсь (Konqueror, Dolphin, Nautilus только).
webdav - это расширение к протоколу http, а его поддерживают все.
Если Вы внимательно посмотрите на
картинку в моем посте выше , то увидите, что пример подключения яндекса через webdav там как раз на Dolphin.
По части операций с файлами у соединения через webdav огромное преимущество над любыми плагинами, но у webdav есть огромный недостаток, но не дает ссылки на шару.
Значит ли это, что мне придется, что-то ставить дополнительно, если с yd-tool не выгорит (н.п. davfs2)? 
Я не буду говорить за (Konqueror, Nautilus) потому что ими не пользуюсь и не знаю как осуществляются настройки в них. В консоль слать Вас тоже не хочется.
Что касается Dolphin то там ничего дополнительного не надо.
если с yd-tool не выгорит
Я с вами согласен, что работу сервиса яндекса в алт нужно настроить, а то у нас из коробки стоят dropbox на котором мало места и где платные расширения, когда облако яндекс может и не гламурно оформлено, но пользоваться им выгоднее.
Потерпите я попробую настроить работу сервиса, но поскольку не программист и не имею отношения к it технологиям не знаю смогу ли. Возможно кто-то еще захочет помочь.
Например Yandex.Disk ServiceMenu работает, но не копирует ссылки в буфер, пытаюсь разобраться почему.
