Поподробнее пожалуйста,как вы его запускали.Дело в том,что wine не запустится если не запустить
вин приложение.
Как реагирует на команду
$winecfg
Да и вообще,побольше информации,какую программу пытались запустить.Тут недавно один человек хотел акронис запихнуть в wine.