Если с правами всё нормально, то проблема может быть ещё и в том, что версия программы скопированного профиля, могла быть более свежей, чем версия запускаемой программы, и соответственно, она не понимает более новый формат конфигов, если он вдруг изменился при переходе с версии на версию. Но обычно при таком случае FF предупреждает при запуске.