XFS - сейчас default для RHEL. Это уже о чём-то говорит. Но они отказываются поддерживать BTRFS.
С другой стороны, SLES, тоже известный и уважаемый дистрибутив, ставит default BTRFS.
В BTRFS сразу есть snapshots. И микро файлы можно хранить в inodes. Ещё BTRFS, по-моему, единственная файловая система, которая хранит дату создания файлов. Вдруг полезно будет.