Именно из-за того, что у Вас при обновлении не обновилась пакетная база, Вам и было предложено поудалять пол системы.
!!!!! Ааа....
!!!
Хорошо, Вы поймите мне-то похер, по большому счету.
Ну поставим мы отлаженное решение на Винде или Убунте и даже на Андройде.
А для заказчиков на Альте (если такие будут) будем всю свою ответственность снимать и честно в том числе и об этом предупреждать.
А вы можете продолжать "подтирать лопухом" и как-то это все оправдывать.
Я же не агитирую, я лишь искренне хочу, чтобы что-то и у вас развернулось лицом к пользователю.
Все реально надоело уже, тем более что решение как обновить уже найдено.
Всего вам хорошего!:-)