Скорей всего, он не нужен, если действительно поддержка udisks2 есть.
Единственная строка с libgdu закомментирована в src/ejecter.vala
Так что не нужен gdu. Надо для начала попытаться с исходников его просто собрать. Если получится, тогда спек править. Исходники по ссылке выше брать.