А если трогать, то вероятность пропажи не больше, чем при работе с разделами, любой другой программой.
Одно время нельзя было уменьшить размера NTFS созданный Вистой, сейчас такого нет. Про Windows 7 ничего сказать не могу - ещё не видел компьютеры с ним.