Проблема, на сколько понимаю, была (и остается) в модуле ядра rtsx_usb_sdmmc (переписка по этому поводу на
kernel.org, в ней можно найти ссылку на баг в
багзиле ядра). В качестве решения можно использовать
инструкцию из первого поста данной темы, либо перезагружать указанный модуль с помощью modprobe при вставленной в кардридер карте, либо создать правило udev (/etc/udev/rules.d/10-RTS5129-autosuspend.rules).
ACTION=="add" , ATTR{idProduct}=="0129" , ATTR{idVendor}=="0bda" , ATTR{power/autosuspend_delay_ms}="2" , ATTR{power/control}="on"
После перезагрузки кардридер работает нормально. За последнее решение спасибо
Vasiliy Kovalev.