Пакет так и называется foliate, он есть в "Центре приложений" (от гнома). Пользоваться программой научился: в версии, поставленной через flatpak, загрузил одну книгу в "Библиотеку", она открылась. После этого скопировал в раздел программы (библиотека) нужную книгу, она тоже открылась. Теперь, если в меню по "Читалке электронных книг" кликнуть правой кнопкой, то появляется строка "Библиотека" и она открывается с книгой, которую читаешь последней. Открыть книгу "с помощью foliate" не работает, "не удалось открыть файл".