Осталось уточнить версии пакетов.
Сделал всё как описывали. Подключил к Интернету, выставил сервер для обновлений altlinux.org, обновил списки пакетов, удалил moodle, установил всё обратно (при том всё закачалось именно с сервера).
Захожу в moodle - версия пакета осталось та же самая - 1.9.2, тесты не работают, ошибки из-за айди всё так же вылазят.
А вы дистрибутив не обновляли случаем полностью?
Странно, что я всё таки делаю не так :)