С wine не все так просто - там же используются библиотеки 3D (libGL), а это значит, что помимо 64битных библиотек должны быть установлены еще и 32битные. И у nvidia, и у ati вроде как свои реализации libGL. Собственно, репозитарий raorn-а как раз и был сделан специально для того, чтобы можно было 32битные проприетарные библиотеки запускать.
Наверное действительно проще засунуть wine в chroot/hasher.