setbranding не всё меняет.
Впрочем - что гадать. Поднимите логи и смотрите установку и снос пакетов, привязав их ко времени ваших экспериментов.
[slav@slav-pc log]$ lsahttpd cron lightdm ppp useralert cups lpr README uucpalterator-mirror daemons mail rpmpkgs wtmpalterator-net-iptables dmesg maillog sa xinetdaudit ftp messages samba Xorg.0.logauth httpd2 mysql secure Xorg.0.log.oldbacula journal news spoolerboot.log journald nvidia-installer.log squidbtmp kernel pm-powersave.log syslogConsoleKit lastlog pm-suspend.log ulogd
[slav@slav-pc ~]$ rpm -qa --lastalterator-standalone-7.1.2-alt1 Ср 19 июл 2017 12:49:48branding-xalt-kworkstation-alterator-8.1.0-alt4.M80P.1 Ср 19 июл 2017 12:49:47alterator-browser-qt5-2.92.1-alt1.M80P.1 Ср 19 июл 2017 12:49:47lightdm-gtk-greeter-2.0.1-alt4.M80P.1 Ср 19 июл 2017 10:10:21branding-xalt-kworkstation-graphics-8.1.0-alt4.M80P.1 Ср 19 июл 2017 10:10:19pam-limits-desktop-0.1-alt2 Пн 17 июл 2017 09:54:15setbranding-1.1.1-alt1 Пн 17 июл 2017 09:52:09flash-plugin-26.0.0.137-release Сб 15 июл 2017 06:01:38postgresql9.6-devel-9.6.3-alt0.M80P.2 Сб 15 июл 2017 04:41:11
Я же правильно понимаю, что послеsetbranding serverони должны стать идентичными?..
journalctl | grep apt-get
$ journalctl -a | grep apt-getиюл 19 07:23:37 Rostov.nksp apt-get[2544]: libpango-1.40.7-alt1 1500361903 installedиюл 19 07:23:37 Rostov.nksp apt-get[2544]: libpango-devel-1.40.7-alt1 1500361903 installedиюл 19 07:23:38 Rostov.nksp apt-get[2544]: libpango-gir-1.40.7-alt1 1500361903 installedиюл 19 07:23:38 Rostov.nksp apt-get[2544]: i586-libpango-1.40.7-alt1 1500362416 installedиюл 19 07:23:38 Rostov.nksp apt-get[2544]: i586-libpango-1.40.6-alt1 1496063016 removedиюл 19 07:23:38 Rostov.nksp apt-get[2544]: libpango-gir-1.40.6-alt1 1496062432 removedиюл 19 07:23:38 Rostov.nksp apt-get[2544]: libpango-devel-1.40.6-alt1 1496062432 removedиюл 19 07:23:39 Rostov.nksp apt-get[2544]: libpango-1.40.6-alt1 1496062432 removed.....
Чем удаляли?
$ journalctl -a | grep apt-get
[slav@slav-pc ~]$ journalctl -a | grep apt-getиюл 15 02:51:19 slav-pc.localdomain systemd[1]: proc-sys-fs-binfmt_misc.automount: Got automount request for /proc/sys/fs/binfmt_misc, triggered by 2978 (apt-get)июл 15 03:18:48 slav-pc.localdomain systemd[1]: proc-sys-fs-binfmt_misc.automount: Got automount request for /proc/sys/fs/binfmt_misc, triggered by 2924 (apt-get)июл 15 04:41:07 slav-pc.localdomain systemd[1]: proc-sys-fs-binfmt_misc.automount: Got automount request for /proc/sys/fs/binfmt_misc, triggered by 3374 (apt-get)июл 17 09:52:09 slav-pc.localdomain systemd[1]: proc-sys-fs-binfmt_misc.automount: Got automount request for /proc/sys/fs/binfmt_misc, triggered by 2970 (apt-get)июл 17 13:10:45 slav-pc.localdomain systemd[1]: proc-sys-fs-binfmt_misc.automount: Got automount request for /proc/sys/fs/binfmt_misc, triggered by 2661 (apt-get)июл 19 10:10:17 slav-pc.localdomain systemd[1]: proc-sys-fs-binfmt_misc.automount: Got automount request for /proc/sys/fs/binfmt_misc, triggered by 2349 (apt-get)июл 21 12:30:32 slav-pc.localdomain systemd[1]: proc-sys-fs-binfmt_misc.automount: Got automount request for /proc/sys/fs/binfmt_misc, triggered by 2898 (apt-get)