Это всё делается посредством dd.
dd if=<источник> of=<цель>
Полезно прочитать про параметры. "bs=" ускорит процесс, так как по-умолчанию bs=512b, а с bs=1024k (к примеру) всё будет веселее. Если if (input file) с плохими секторами, полезна будет подстановка сектора с нулями, чтобы у of (output file) геометрия не поползла. в общем, параметров у dd не мало, читайте.