Я не знаю что было с диском или материнской платой перестовляли или нет. Но нужно устранить это.
Ну так устраните. Ясно же написано:
ALERT! /dev/disk/by-uuid/3a9fe318-fcc6-495d-9f0a-09246b81fa2a does not exist. Droping to a shell!
То есть, где-то у Вас, в fstab, в загрузчике и т.п. есть ссылка на устройство с UUID 3a9fe318-fcc6-495d-9f0a-09246b81fa2a. Надо разобраться, куда оно делось, и почему. UUID меняется при форматировании раздела, например. Либо, может быть, вовсе физическое устройство (hdd/ssd/и т.п.) отключено. Если же UUID поменялся осознанно, надо в соответствующем месте другой UUID прописать.
От замены материнской платы и перестановки hdd куда-нибудь UUID раздела не меняется, это были неправильные вопросы.