А Вы посмотрите какие модули стоят
$ rpm -qa | grep kernel
У меня после обновления ядра не все обновилось, остались старый modules-virtualbox и от 3.10 ядра остались модули. Менял их в ручную.
Вот щас опять будут закидывать тапками про плохие советы, но я же не виноват, что update-kernel не все обновляет...