Последний сентябрьский стартеркит как раз нормально перескакивает на 4.9
Проблема с прошлым стартеркитом, он не может нормально обновиться. А установлено на нём уже штук 10 серверов, всё переустанавливать слишком много работы, лезть в каждый сервер /etc/initrd.mk что то там править тоже не правильно, эта проблема должна решаться на уровне разработчиков дистрибутива. Некрасиво такие обновления выкладывать, после которых приходишь в понедельник, а сервера не загрузились все в initramfs стоят. Недавно с etcnet такая же проблема была, целый день не мог понять почему у всех виртуалок сеть пропала. Кривой etcnet выложили в обновлениях, молодцы!