Вообще говоря, в иерархии директорий файловой системы линукс систем есть место, куда следует монтировать любые нелокальные ресурсы (во всяком случае те, которые не относятся к локальной системе). Это /mnt. Что вам мешает примонтировать туда всё необходимое, а на рабочем столе лишь создать ссылки на точки монтирования (директории монтирования) из /mnt ? Даже если ссылку удалят, ресурс все равно будет смонтирован и будет доступен. Пересоздать ссылку (тот же ярлык в виндовсе) не проблема вообще.
Рабочий стол в линукс графических рабочих окружениях и винде - две большие разницы, особенно в свете наличия в линуксе монтирования.