Лично я испокон веков пользуюсь динамической версией (раньше статической версией, но их перестали давно собирать).
Скачивается архив, распаковывается в в /opt (это для меня наиболее удобно, держать там такой софт - скайп, MATLAB и прочее в том же духе) и все. Главное, не забывать подтирать старые версии.
За давностью лет не помню, но возможно, я что-то еще дополнительно предпринимал типа подправить ld.conf или что-то типа того, потому что у меня в /opt есть еще симлинк, который я руками правлю на последнюю версию. Хотя это может и для удобства, чтобы меню не нужно было править при смене версии скайпа.