СПС! Надо с полным путём указывать команду надо было.
/opt/mssql-tools/bin/sqlcmd
Далее вышла ошибка в отсутствии драйвера. Сделал репак:
msodbcsql17-17.6.1.1-1.x86_64.rpm
Установил.
В /etc/odbcinst.ini прописал:
[ODBC Driver 17 for SQL Server]
Description=Microsoft ODBC Driver 17 for SQL Server
Driver=/opt/microsoft/msodbcsql17/lib64/libmsodbcsql-17.6.so.1.1
UsageCount=1
Всё прошло успешно.