Приветствую!
В моем случае файловую систему не менял, использую по стандарту ext2/ext3.
С подобной ошибкой сталкивался при разворачивании Symply и Centaurus, выдавало ошибку обновления, помогало увеличение SWOP раздела. А в данном случае уже и SWOP увеличил до 10Г, а проблема остается.