1. Ни каких дополнительных программ, тем более виндовых, для установки Линукса второй системой не требуется, достаточно штатных возможностей инсталятора (проверено на очень большом кол. ПК). Алгоритм до смешного простой и довольно безопасный, если не совершать преднамеренного удаления или других грубых нарушений "инструкции". В момент выбора режима разметки, выбрать ручную, выбрать виндовый раздел и дать команду уменьшить на ... размер на сколько надо уменьшить, зависит от устанавливаемого дистра, если ставить специально заточенный под такую домашне-ученическую установку дистр, то достаточно 3-5 Гб (своп, корень 2 Гб и под /home остальное), а потом дать команду возврата на предыдущий шаг\экран и выбрать опять первый пункт "использовать не размеченное пространство). Всё, дальше инсталятор сам выполнит нужную разметку и установку. У нас "тётеньки", которые сами ни когда ни чего не устанавливали из ОС, по простенькой бумажной инструкции без ошибок выполняют такую процедуру, не говоря уже про продвинутых учеников.
2. Ставить на ПК систему не обязательно, и можно обойтись без ЛавСД, как вариант, получившийся на основе опыта, установка системы на 2 Гб флешку. Цена таких флешек сейчас около 200-300 р., правда нужен ПК с поддержкой загрузки с флешки. Удобно в плане того, что ученик может работать и в классе с этой своей системой, плюс возможность записи на флешку нужных материалов. Домашний ПК при этом ни чем не рискует.