А смысл собирать для x86_64?
Чтобы не было лишней головной боли. Зачем это надо в полностью 64-разрядной системе ?
Grub4dos = 1 файл grldr, который может быть расположен на любом основном разделе, в том числе и win-разделе. Находит себя автоматически.
В удалённом разделе тоже себя находит ?

У меня аварийная флешка с drub4dos, я не боюсь сломать загрузчик. А GRUB2 отдельно от ОС живёт?
В случае умения восстановить загрузчик, совсем не важно, с чего грузиться. А Груб живёт в /boot/grub. Если его, а, лучше, весь /boot, вынести на отдельный раздел, будет на отдельном. Но я предпочитаю lilo. Впрочем, /boot делаю отдельный чаще всего.
Кстати, если на CD/флешке есть lilo, стандартный mbr можно записать и им:
-M master-device [mbr|ext]
Install a Master Boot Record on the device specified as
master-device, selecting the Standard or Extended Master
Boot Loader per the option. The primary partition table on
master-device is undisturbed. If no valid Volume-ID
(serial number) is present, then generate one and write it
to the MBR. If mbr is specified, the Standard Master Boot
Loader will search partitions 1-4 for an active flag, and
boot the flagged partition. Only one active flag is
allowed. If ext is specified, the search for an active
partition will include extended partitions as well. The
presence of the Extended Master Boot Loader on the Master
Boot Record (MBR = sector 0) of a disk affects the opera
tion of the -A option.