Похоже, вы обнаружили багу в пакете. У себя я тоже проверил - журналы даже не создаются, то есть, все галки в настройках стоят (писать в журнал смену статуса и остальные). Боюсь, надо в багзиллу (багтрекер) писать.
PS Также не нашел ничего похожего на журналы пиджина. У меня другой клиент рабочий, но пиджин установился вместе с дистрибутивом, я его сносить не стал.