1. Любой сервис включается/выключается из автостарта так:
chkconfig имя_сервиса on[off]
2. Есть простая команда - poweroff.
3. Я лично использую для резервного копирования любой архиватор + cron, по расписанию. Есть мощная система Amanda, но лично я ее никогда не пробовал. Форматировать винты (и не только винты) - mkfs. Для ясности:
man mkfs
4. У меня putty работает, использую регулярно.
5. Зайдите в web-альтератор в консоли (links
https://127.0.0.1:8080) либо с любой другой машины в сети, и настройте там все, что хотите.