На сколько я знаю. Пакет WINE-VANILA является модификацией wine, в которой пытаются реализовать такую вещь: чтобы виндовые проги ставились как бы через менеджер пакетов.
Сам я эту модификацю не пробовал, но думаю когда в wine устанавливаешь программу она появляется в списках синаптика. Я думаю такая возможность тебе даже не нужна.
Поэтому перейди назад на обычный wine, ничего не потеряешь.
