Аналогичная проблема. При работе с таблицами в какой-то момент всё начинает дико тормозить. Памяти используется мало (500--600 Мб из 2 Гб), своп не задействован. Просмотр в Gnome-system-monitor, запущенном под рутом, выдаёт некий рутовый процесс, называемый X, потребляющий 0 оперативки, но грузящий одно ядро на 100%. Работать невозможно до такой степени, что пришлось перейти на gnumeric.
Ноутбук Lenovo 3000 N 500, процессор T5800.