Править код установщика надо.
Это реально самому сделать?
Да, если это скрипт на bash. Но там исполняемый бинарный файл, следовательно, возможны следующие варианты:
* скачать исходный код и собирать самостоятельно;
* посмотреть через strace вызов su и сделать подмену враппером
* написать письмо в Alfresco с просьбой разъяснить, с каким параметром они вызывают su и как из экзотический инсталлятор запустить на ALT Linux.
P.S. Раньше таких проблем не было:
http://forum.altlinux.org/index.php?topic=3316.0