Thx, добавил: тыц
По поводу
У вас virtualbox обновился (4.2.4), но не обновились его модули ядра (4.1.4).
можно добавить там было, что обычные пакеты в ALT не могут иметь зависимости на ядро и модули. Такова политика, связанная с тем, что обновление ядра должно быть обдуманным шагом, и ядро не должно обновляться случайным образом, в составе какого-то общего обновления. В общем, после обновления таких пакетов, которые завистят от модулей ядра, модули ядра следует обновить отдельно. А помочь может update-kernel. Ядро у него std-def там, так что просто без параметров запустить.
Ставить update-kernel, кажется, не надо: вроде во всех дистрибутивах 6-ой платформы, кроме server light, он есть уже.