А если "забить" на синаптик и просто установить перенесенные пакеты командой:
apt-get install имя_файла_пакет1, имя файла_пакет2 ... имя_файла_пакет_N
Кстати, ведь та, "стоящая в стороне от интернета система" видимо давно не обновлялась...
Не может такая "точечная" установка это привести к конфликтам?
Если мне не изменяет память, то после установки системы с дистрибутива, ссылка на него остается в списке репозиториев системы. И с него (с диска) можно что-то доустановить например.
Как вариант видимо можно попробовать скачать на флэшку свежий дистрибутив того бранча который установлен на пациенте, подключить его на нем в качестве репозитория и установить/обновить оттуда все что потребуется? Или такой способ не сработает по какой-то причине?