Разве вы не создаёте новую разметку на старом диске после его копирования?
зачем ?
Странный вопрос.
Если вы скопировали всю систему на новый накопитель, то для чего оставлять в компьютере точную копию на старом накопителе, да хоть даже старую раметку?
Обычно люди используют старый накопитель как место для хранения файлов, а это удобнее делать на одном разделе. Или ставят на него другую ОС, что тоже подразумевает смену разметки под новые нужды. В любом случае, изменённые разделы получат новые UUID.