Команда копирования заканчивается в момент полного копирования файцла в буфер обмена вовода-вывода (дальше она не работает и передаёт дальнейшие дествия по копированию ядру). Реально флешка освобождается в момент сброса файла из буфера обмена (кэша дискового ввода/вывода) на диск, это для больших файлов также занимает определённое время.
