А можно сделать так чтобы тока часть пакетов обновлялось из Сизиф?(тот же Firefox)
Нет.
Пакеты тесно связаны.
Например, Firefox потянет за собой ряд библиотек.
Так некоторые из этих библиотек заведомо используются иными программами, эти программы также придётся обновлять (точнее, это должно произойти автоматически, если всё делается правильно). Далее добавятся ещё библиотеки и ещё программы. При этом, если вы не делаете dist-upgrade, скорее всего вам окажется по силам в достаточной мере нарушить работоспособность системы.
Если очень нужно обновление пакетов, — надо делать запросы на это через багзиллу.
Если очень-очень нужно, а майнтейнер не уделяет данному вопросу достаточно внимания, — осваиваем хашер и собираем пакет в локальном окружении.
