Долго наблюдал и экспериментировал. Выявил вот что - при долго нагрузке на CPU 100%, это может быть с любой программой, активируется kworker, а точнее kworker/0:1, kworker/0:2, kworker/0:3, kworker/0:0 и полностью пожирают весь CPU. Что делать я даже не представляю, так как все логи пустые, а работать так нельзя. Походу пора уходить на старое ядро.