Читайте исходники, /usr/share/kde4/apps/plasma-*/init/ и /usr/share/kde4/apps/plasma/layout-templates/
И? В этих исходниках прописано последовательность добавления при генерации.
В том же, что касается отдельных апплетов... То для отдельных же апплетов (как минимум дефолтных альтовских) смотрим выше: все подхватывается автоматом (в не зависимости сгенерированы они, или добавлены в ручную) и не требует вмешательства в свои настройки (и языковая локаль, и часовой пояс, и содержимое трея, и количество рабстолов, и меню по кнопке К, настройки же таскбара годятся под любую систему).
Разве что , в случае дефолтных апплетов Альта, календарь от часов. Но показ праздников можно отключить по дефолту и их, коли надо, добавит сам юзер.
Не вижу проблем с универсальностью.
Да даже если добавить апплеты с опенглушными красотами, то на неподходящей системе, красоты, автоматом игнорируются. Дальше?