Обновил систему по Вашей рекомендации.
Результат немного изменился.
Графическая оболочка по прежнему запускается с гаммой 1.0, но зато это стало отражаться в окне с полосками настройки гаммы.
Когда я устанавливаю новые значения (2.6) при установленной птичке на xorg.conf то появляется окошко, которое предлагает мне ввести пароль администратора для подтверждения ввода нового значения.
Я ввожу, подтверждаю "ОК", но при перезапуске программы все остается по старому, то есть гамма 1.0.