Зачем же тогда LVM стоит в авторазметке, галочка напротив LVM стоит изначально.
Я не знаю где там и что стоит, и кто его туда поставил...

И это наверняка зависит от выбранного дистрибутива и взятого имиджа (тем более, автор проблемы так и не пишет что у него там установлено и обновлялось!).
Но пользователю, когда он устанавливает систему, да ещё на свой
домашний компьютер нужно: а). не спешить + б). думать что делает + в). читать и читать:
man, man и ещё раз man!
© В.И.Ленин
P.S. LVM "с галочкой по умолчанию", насколько помню, ввёл, в своё время,
единственный (из всех "интернациональных", по крайней мере) дистрибутив - Fedora. Но дистрибутив тот - крайне специфичный, draft-тестер для RedHat, который ориентирован на
крупные промышленные сервера, а никак не на домашние забавы. Им можно и LVM по дефаулту ставить...