# rpm -ql yandex-browser-stable
удали из этих каталогов, он вроде культурно разложен в системе /usr/lib64/yandex/browser ну и настроечных несколько файлов.
Чтобы удалить пакет yandex-browser-stable без удаления его зависимостей, можно использовать команду rpm с опцией -e и ключом --nodeps.
rpm -e --nodeps yandex-browser-stable
Это не средство, а идея, сам не пробовал.