Вопрос - где ещё ошибка?
Расхождение может быть от того, что при простом суммировании предметы, где класс разбивается на подгруппы, будут входить в сумму несколько раз.
Табель учёта рабочего времени можно использовать в качестве достоверного источника информации о нагрузке только в том случае, если у вас работает контроль своевременного и полного заполнения журнала. Инструменты для этого в РУЖЭЛЬ есть, но я пока что нигде, кроме Гимназии 45 не видел, чтобы их использовали в полном объёме. Мало кто добивается того, чтобы табличка "план/дано" не показывала расхождения.
Теоретическую нагрузку можно посчитать просуммировав цифры в столбцах учебного плана. Пожалуй, строку с суммой мне стоит добавить.